Bad Honnef hat zwei DB-Bahnhöfe, einen in Rhöndorf und einen in Bad Honnef. Von dort sind es fußläufig nur wenige Minuten in die Innenstadt. In rhöndorf hingegen kann man ideal in die Stadtbahnlinie 66 nach Bad Honnef oder Siegburg (über Bonn) umsteigen. Hier ist der Zugang weitestgehend barrierefrei.
Zahlreiche Regionalzüge von und nach Mönchengladbach, Köln (auch Flughafen), Bonn-Beuel oder Koblenz fahren Bad Honnef regelmäßig an.
Unweit des DB-Bahnhofs liegt die Start- bzw. Endhaltestelle der Stadtbahnlinie 66, über die man Honnefs Stadtteile Rommersdorf und Rhöndorf sowie unter anderem die Orte Königswinter, Bonn, St. Augustin oder Siegburg erreichen kann.
Buslinien
Über zahlreiche Buslinien, die regelmäßig fahren, können Besucher auch den Bergbereich von Bad Honnef, den Stadtteil Aegidienberg, sowie umliegende Orte wie Oberpleis, Ittenbach oder Asbach, anfahren.
Bus 521
Königswinter-Oberpleis Busbf – Ittenbach Busbf – Königswinter Bf
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Bus 526
Königswinter-Ittenbach Busbf – Bad-Honnef-Aegidienberg – Hövel – Königswinter-Ittenbach Busbf
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Bus 560
Bad Honnef Bf – Aegidienberg – Königswinter-Oberpleis Busbf
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Bus 562
Neustadt (Wied) – Asbach (Ww) { Bad Honnef-Wülscheid | Asbach-Windhagen } Aegidienberg – Himberg – Bad Honnef (Stadtbahn)
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Bus 565
Bad Honnef (Stadtbahn) – Unkel-Rheinbreitbach – Unkel Bf – Linz Bf
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Bus 566
Bad Honnef, Drieschweg – Selhof – Bad Honnef Mitte – Bad Honnef-Rhöndorf Bf (Stadtbahn)
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